Основана продюсером Питером Хауке и его менеджментом Popo в 1970 году.
Первоначально базировавшаяся в Ной-Изенбурге (к югу от Франкфурта) студия Bacillus выпустила свою первую партию пластинок в начале 1971 года. Первые 10 пластинок и 7 синглов были распространены немецкой фирмой Philips (хотя на релизах об этом не говорилось) и имели белые базовые этикетки только с черным принтом.
В конце 1971 года, после того как лейбл добился небольшого успеха, они решили найти более отзывчивого и преданного партнера и подписали контракт с местной франкфуртской компанией Bellaphon в качестве производителя и дистрибьютора, дебютировав с альбомом Nektar "Journey To The Center Of The Eye". Распространяемая Bellaphon этикетка Bacillus LP имела отличительную многоцветную основу и каталожные номера Bellaphon BLPS.
Все еще под эгидой Питера Хауке, но с помощью Bellaphon, Bacillus превратились в один из ведущих лейблов прогрессивного / краут-рока в Германии, с реестром успешных международных исполнителей, таких как Nektar, Omega и Krokodil, а также местных немецких талантов.
Позже экспериментальный характер Bacillus распространился и на сегмент дискотек. Ganymed должны были перенести образ краутрока на танцпол. После довольно спокойного периода с новыми релизами хард-рока, диско и хэви-метала, а также переизданиями CD из бэк-каталога Bacillus Records в 1990-х годах, в 2012 году они снова начали выпускать новых исполнителей и переиздания ограниченным тиражом. С тех пор основным направлением деятельности лейбла в основном является рок-музыка, сделанная в Германии.